Le médecin d'établissement a une pratique très différente de celle du médecin de famille ou du spécialiste. Les rapports qu'il entretient avec les enfants, les adultes handicapés s'inscrivent dans le quotidien. Ils doivent avoir pour but une optimisation de leur état de santé, pour un plus grand confort de vie et un meilleur impact des activités éducatives. Le plus grand soin doit être apporté au diagnostic initial, qui permet d'orienter les actions thérapeutiques et de fournir une référence pour le contrôle des évolutions.

Tout doit être fait pour la personne handicapée dans l'optique qu'elle vive au mieux avec son handicap : minimiser les complications, et limiter les problèmes médicaux aux impondérables.

Plusieurs symptômes cliniques sont présents chez le même sujet et ne doivent pas être traités séparément, compte tenu des interactions cliniques et thérapeutiques. Si le handicap nécessite une approche pluridisciplinaire, la démarche médico-rééducative doit tenir compte de chaque élément, mais aussi de la globalité de la personne.